Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
VAX2Q9UIW0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAX2Q9UIW0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms