Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP1R1BQ9UD71 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms