Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLN8Q9UBY8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN8Q9UBY8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms