Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms