Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms