Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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HOXC10Q9NYD6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC10Q9NYD6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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