Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPMQ9NSP4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms