Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTNNBIP1Q9NSA3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms