Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CMC2Q9NRP2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CMC2Q9NRP2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms