Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LHX9Q9NQ69 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms