Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms