Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2J2Q9GZM3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms