Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CEP44Q9C0F1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms