Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMES1Q9C002 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NMES1Q9C002 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NMES1Q9C002 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NMES1Q9C002 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NMES1Q9C002 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NMES1Q9C002 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMES1Q9C002 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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