Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP1Q9C000 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms