Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM8Q9BZR9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms