Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms