Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARXQ96QS3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARXQ96QS3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms