Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms