Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SHDQ96IW2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms