Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AL513285.1-201ENST00000423187 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MS4A3Q96HJ5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms