Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC34Q96HJ3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC34Q96HJ3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms