Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC97Q96F63 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms