Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NMD3Q96D46 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NMD3Q96D46 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms