Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHMTQ93088 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHMTQ93088 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms