Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATAD2BQ8WXI9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATAD2BQ8WXI9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms