Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms