Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ANKRD42Q8N9B4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ANKRD42Q8N9B4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ANKRD42Q8N9B4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ANKRD42Q8N9B4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ANKRD42Q8N9B4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ANKRD42Q8N9B4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ANKRD42Q8N9B4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD42Q8N9B4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD42Q8N9B4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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