Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP13Q86W25 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NLRP13Q86W25 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms