Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC80Q76M96 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms