Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MED13LQ71F56 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED13LQ71F56 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MED13LQ71F56 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED13LQ71F56 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms