Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP188Q5SRE5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP188Q5SRE5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms