Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms