Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms