Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC57Q2TAC2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms