Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RRN3P1Q2M238 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RRN3P1Q2M238 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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RRN3P1Q2M238 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RRN3P1Q2M238 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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