Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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GEN1Q17RS7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GEN1Q17RS7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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