Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP6Q16828 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP6Q16828 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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