Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ME3Q16798 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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ME3Q16798 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME3Q16798 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME3Q16798 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME3Q16798 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME3Q16798 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME3Q16798 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME3Q16798 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME3Q16798 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME3Q16798 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME3Q16798 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME3Q16798 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME3Q16798 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME3Q16798 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME3Q16798 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME3Q16798 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME3Q16798 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME3Q16798 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME3Q16798 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME3Q16798 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME3Q16798 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ME3Q16798 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME3Q16798 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME3Q16798 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME3Q16798 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME3Q16798 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME3Q16798 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ME3Q16798 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
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