Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LAMA3Q16787 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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