Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFE2Q16621 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms