Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACKR1Q16570 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACKR1Q16570 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms