Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIP13Q15645 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms