Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRADDQ15628 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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