Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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UBE3CQ15386 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE3CQ15386 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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