Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMC1AQ14683 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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