Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SQLEQ14534 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms