Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRIM25Q14258 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms