Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CUL4BQ13620 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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