Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEUROD1Q13562 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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